10x Genomics 單細胞轉錄組測序


    10x Genomics 單細胞轉錄組測序


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      利用單細胞轉錄組學和深層組織蛋白質組學成功繪制老化肺圖譜

      ? ? ? 衰老導致了肺功能下降,增加了慢性肺病的易感性,這已經成為全球第三大死亡原因。本研究利用單細胞測序研究年輕小鼠和老年小鼠的肺部細胞差異,以揭示肺部老年化的機制,從小鼠肺部的不同細胞類型,肺衰老過程中細胞變化和基因變化以及相關功能等方面切入探索。研究發現衰老導致了轉錄噪音的增加,表觀調控異常以及細胞衰老的特征,同時,還發現2?型肺泡壁細胞和脂成纖維細胞中2?型膽固醇生物合成有所增加,且氣道上皮細胞的相對比例發生了改變。蛋白質組學分析顯示老年小鼠細胞外基質重構,包括IV?型膠原和XVI?型膠原增加,Fraser?綜合征復雜蛋白和XIV?型膠原減少。本研究利用老化蛋白組與單細胞轉錄組的整合分析預測了調控蛋白的細胞來源,并創建了一個無偏倚的老化肺參考圖譜。




      圖1 研究技術路線圖





      圖2 ?小鼠肺部細胞亞群鑒定結果




      圖3 ?衰老導致了大多數細胞的轉錄噪音增加



      圖4 ?2?型肺泡細胞和脂成纖維細胞的2?型膽固醇生物合成的增加

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