真核轉錄組測序


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      RNA測序確定了香煙煙霧暴露與人類氣道上皮細胞復制性衰老之間的共同通路


      衰老受遺傳和環境因素的影響,吸煙與衰老細胞的積累密切相關。在這項研究中,作者想要確定吸煙情況下潛在的有益于細胞生存的基因,從而可能有助于對細胞衰老發展的探索。該研究從5?個健康人中獲取了原發性人支氣管上皮細胞進行培養,然后使用(或不使用)1.5%?香煙煙霧提取物(CSE)處理24?小時,或者傳代至復制衰老階段,利用RNA-seq?對CSE?和non-CSE?處理的暴露細胞進行轉錄組測序,同時,對復制衰老階段的細胞也進行轉錄組測序。研究發現1534?個基因在衰老過程中受到不同程度的調控,599?個基因在CSE?暴露后受到不同程度的調控,其中,243?個基因在兩種條件下都發生了改變,表現為強富集,在兩種條件下的通路和過表達基因集屬于調節活性氧,蛋白酶體降解和NF-κB?信號的細胞過程。研究結果為了解細胞老化和暴露于香煙煙霧中的基因表達反應提供了深入的見解,并確定了被香煙煙霧改變的潛在分子通路,這些通路也可能促進氣道上皮細胞衰老。

      圖1 在pHBECs 中復制性衰老或CSE 暴露后表達變化的鑒定




      2 復制性衰老和CSE?誘導的基因表達變化之間存在明顯的重疊



      3CSE和衰老反應基因共有的Pathway?富集結果

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